Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cacna1sQ02789 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacna1sQ02789 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacna1sQ02789 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms