Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GscQ02591 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GscQ02591 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GscQ02591 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GscQ02591 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GscQ02591 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GscQ02591 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GscQ02591 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GscQ02591 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GscQ02591 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GscQ02591 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GscQ02591 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GscQ02591 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GscQ02591 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GscQ02591 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GscQ02591 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GscQ02591 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GscQ02591 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GscQ02591 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GscQ02591 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GscQ02591 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GscQ02591 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GscQ02591 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GscQ02591 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GscQ02591 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GscQ02591 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GscQ02591 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GscQ02591 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GscQ02591 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GscQ02591 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GscQ02591 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GscQ02591 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GscQ02591 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GscQ02591 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GscQ02591 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GscQ02591 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GscQ02591 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GscQ02591 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GscQ02591 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GscQ02591 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GscQ02591 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GscQ02591 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GscQ02591 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GscQ02591 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GscQ02591 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GscQ02591 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GscQ02591 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GscQ02591 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GscQ02591 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GscQ02591 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GscQ02591 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GscQ02591 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GscQ02591 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GscQ02591 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GscQ02591 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GscQ02591 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GscQ02591 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GscQ02591 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GscQ02591 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GscQ02591 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GscQ02591 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GscQ02591 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GscQ02591 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GscQ02591 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GscQ02591 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GscQ02591 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GscQ02591 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GscQ02591 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GscQ02591 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GscQ02591 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GscQ02591 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GscQ02591 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GscQ02591 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GscQ02591 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GscQ02591 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GscQ02591 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GscQ02591 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GscQ02591 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GscQ02591 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GscQ02591 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GscQ02591 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GscQ02591 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GscQ02591 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GscQ02591 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GscQ02591 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GscQ02591 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GscQ02591 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GscQ02591 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GscQ02591 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GscQ02591 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GscQ02591 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GscQ02591 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GscQ02591 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GscQ02591 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GscQ02591 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GscQ02591 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GscQ02591 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GscQ02591 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GscQ02591 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GscQ02591 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms