Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlh1Q02576 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlh1Q02576 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms