Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pdcd1Q02242 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms