Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RykQ01887 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RykQ01887 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RykQ01887 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RykQ01887 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RykQ01887 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RykQ01887 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RykQ01887 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RykQ01887 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RykQ01887 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RykQ01887 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RykQ01887 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RykQ01887 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RykQ01887 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RykQ01887 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RykQ01887 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RykQ01887 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RykQ01887 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RykQ01887 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RykQ01887 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RykQ01887 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RykQ01887 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RykQ01887 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RykQ01887 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RykQ01887 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RykQ01887 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RykQ01887 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RykQ01887 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RykQ01887 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RykQ01887 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RykQ01887 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RykQ01887 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RykQ01887 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RykQ01887 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RykQ01887 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RykQ01887 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RykQ01887 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RykQ01887 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RykQ01887 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RykQ01887 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RykQ01887 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RykQ01887 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RykQ01887 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RykQ01887 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RykQ01887 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RykQ01887 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RykQ01887 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RykQ01887 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RykQ01887 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RykQ01887 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RykQ01887 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RykQ01887 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RykQ01887 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RykQ01887 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RykQ01887 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RykQ01887 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RykQ01887 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RykQ01887 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RykQ01887 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RykQ01887 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RykQ01887 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RykQ01887 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RykQ01887 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RykQ01887 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RykQ01887 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RykQ01887 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RykQ01887 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RykQ01887 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RykQ01887 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RykQ01887 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RykQ01887 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RykQ01887 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RykQ01887 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RykQ01887 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RykQ01887 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RykQ01887 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RykQ01887 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RykQ01887 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RykQ01887 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RykQ01887 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RykQ01887 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RykQ01887 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RykQ01887 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RykQ01887 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RykQ01887 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RykQ01887 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RykQ01887 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RykQ01887 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RykQ01887 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RykQ01887 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RykQ01887 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RykQ01887 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RykQ01887 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RykQ01887 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RykQ01887 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RykQ01887 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RykQ01887 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RykQ01887 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RykQ01887 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RykQ01887 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms