Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Top2aQ01320 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Top2aQ01320 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Top2aQ01320 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms