Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EgfrQ01279 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EgfrQ01279 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms