Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbp4Q00724 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rbp4Q00724 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms