Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itga4Q00651 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms