Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
F8a1Q00558 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
F8a1Q00558 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms