Protein–RNA interactions for Protein: P97798

Neo1, Neogenin, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neo1P97798 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Neo1P97798 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Neo1P97798 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Neo1P97798 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Neo1P97798 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Neo1P97798 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Neo1P97798 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Neo1P97798 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Neo1P97798 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Neo1P97798 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Neo1P97798 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Neo1P97798 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Neo1P97798 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Neo1P97798 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Neo1P97798 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Neo1P97798 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Neo1P97798 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Neo1P97798 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Neo1P97798 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Neo1P97798 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Neo1P97798 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Neo1P97798 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Neo1P97798 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Neo1P97798 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Neo1P97798 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Neo1P97798 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Neo1P97798 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Neo1P97798 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Neo1P97798 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Neo1P97798 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Neo1P97798 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Neo1P97798 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Neo1P97798 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms