Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AlkP97793 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AlkP97793 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AlkP97793 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AlkP97793 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AlkP97793 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AlkP97793 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AlkP97793 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AlkP97793 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AlkP97793 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AlkP97793 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AlkP97793 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AlkP97793 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AlkP97793 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AlkP97793 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AlkP97793 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AlkP97793 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AlkP97793 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AlkP97793 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AlkP97793 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AlkP97793 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AlkP97793 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
AlkP97793 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AlkP97793 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AlkP97793 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
AlkP97793 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AlkP97793 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AlkP97793 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AlkP97793 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AlkP97793 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AlkP97793 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AlkP97793 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AlkP97793 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AlkP97793 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AlkP97793 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AlkP97793 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AlkP97793 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AlkP97793 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AlkP97793 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AlkP97793 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AlkP97793 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
AlkP97793 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
AlkP97793 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AlkP97793 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
AlkP97793 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AlkP97793 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AlkP97793 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AlkP97793 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AlkP97793 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AlkP97793 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AlkP97793 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AlkP97793 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AlkP97793 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AlkP97793 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
AlkP97793 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
AlkP97793 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AlkP97793 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AlkP97793 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AlkP97793 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AlkP97793 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AlkP97793 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AlkP97793 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AlkP97793 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AlkP97793 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AlkP97793 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AlkP97793 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AlkP97793 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AlkP97793 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AlkP97793 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AlkP97793 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AlkP97793 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AlkP97793 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AlkP97793 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AlkP97793 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AlkP97793 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AlkP97793 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AlkP97793 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AlkP97793 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AlkP97793 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AlkP97793 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AlkP97793 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AlkP97793 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AlkP97793 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AlkP97793 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AlkP97793 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AlkP97793 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AlkP97793 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AlkP97793 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AlkP97793 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AlkP97793 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AlkP97793 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
AlkP97793 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AlkP97793 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AlkP97793 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AlkP97793 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AlkP97793 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
AlkP97793 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AlkP97793 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AlkP97793 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AlkP97793 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms