Protein–RNA interactions for Protein: P97357

Taf1a, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1aP97357 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1aP97357 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1aP97357 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1aP97357 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1aP97357 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1aP97357 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1aP97357 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1aP97357 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1aP97357 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1aP97357 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1aP97357 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1aP97357 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1aP97357 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1aP97357 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1aP97357 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1aP97357 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1aP97357 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1aP97357 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1aP97357 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1aP97357 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1aP97357 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1aP97357 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1aP97357 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf1aP97357 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms