Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RptnP97347 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RptnP97347 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RptnP97347 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RptnP97347 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RptnP97347 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RptnP97347 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RptnP97347 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RptnP97347 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RptnP97347 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RptnP97347 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RptnP97347 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RptnP97347 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RptnP97347 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RptnP97347 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RptnP97347 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RptnP97347 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RptnP97347 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RptnP97347 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RptnP97347 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RptnP97347 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RptnP97347 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RptnP97347 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RptnP97347 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RptnP97347 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RptnP97347 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RptnP97347 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RptnP97347 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RptnP97347 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RptnP97347 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RptnP97347 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RptnP97347 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RptnP97347 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RptnP97347 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RptnP97347 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RptnP97347 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RptnP97347 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RptnP97347 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RptnP97347 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RptnP97347 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RptnP97347 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RptnP97347 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RptnP97347 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RptnP97347 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RptnP97347 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RptnP97347 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RptnP97347 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RptnP97347 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RptnP97347 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RptnP97347 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RptnP97347 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RptnP97347 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RptnP97347 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RptnP97347 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RptnP97347 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RptnP97347 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RptnP97347 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RptnP97347 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RptnP97347 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RptnP97347 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RptnP97347 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RptnP97347 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RptnP97347 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RptnP97347 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RptnP97347 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RptnP97347 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RptnP97347 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RptnP97347 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RptnP97347 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RptnP97347 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RptnP97347 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RptnP97347 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RptnP97347 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RptnP97347 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RptnP97347 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms