Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gfi1P70338 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms