Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cux2P70298 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cux2P70298 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cux2P70298 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cux2P70298 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Cux2P70298 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cux2P70298 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cux2P70298 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cux2P70298 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux2P70298 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux2P70298 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cux2P70298 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms