Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sycp3P70281 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sycp3P70281 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms