Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vamp7P70280 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp7P70280 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms