Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chl1P70232 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chl1P70232 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chl1P70232 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chl1P70232 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chl1P70232 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chl1P70232 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chl1P70232 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chl1P70232 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chl1P70232 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Chl1P70232 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Chl1P70232 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chl1P70232 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chl1P70232 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Chl1P70232 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chl1P70232 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chl1P70232 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chl1P70232 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Chl1P70232 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Chl1P70232 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Chl1P70232 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chl1P70232 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chl1P70232 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chl1P70232 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chl1P70232 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chl1P70232 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chl1P70232 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chl1P70232 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chl1P70232 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chl1P70232 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chl1P70232 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Chl1P70232 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chl1P70232 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Chl1P70232 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chl1P70232 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chl1P70232 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chl1P70232 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chl1P70232 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chl1P70232 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chl1P70232 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Chl1P70232 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Chl1P70232 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chl1P70232 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chl1P70232 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chl1P70232 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chl1P70232 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Chl1P70232 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chl1P70232 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Chl1P70232 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chl1P70232 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chl1P70232 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Chl1P70232 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chl1P70232 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chl1P70232 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chl1P70232 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Chl1P70232 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Chl1P70232 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Chl1P70232 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chl1P70232 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chl1P70232 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Chl1P70232 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chl1P70232 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chl1P70232 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chl1P70232 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chl1P70232 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chl1P70232 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chl1P70232 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chl1P70232 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chl1P70232 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chl1P70232 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chl1P70232 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chl1P70232 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chl1P70232 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chl1P70232 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chl1P70232 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chl1P70232 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chl1P70232 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chl1P70232 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chl1P70232 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chl1P70232 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chl1P70232 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chl1P70232 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chl1P70232 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chl1P70232 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chl1P70232 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chl1P70232 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chl1P70232 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Chl1P70232 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Chl1P70232 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Chl1P70232 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chl1P70232 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Chl1P70232 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Chl1P70232 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chl1P70232 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chl1P70232 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chl1P70232 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chl1P70232 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chl1P70232 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chl1P70232 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chl1P70232 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms