Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SbdsP70122 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SbdsP70122 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SbdsP70122 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SbdsP70122 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SbdsP70122 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SbdsP70122 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SbdsP70122 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SbdsP70122 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SbdsP70122 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms