Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkcbP68404 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms