Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnab1P63143 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms