Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps27aP62983 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rps27aP62983 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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