Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Depdc5P61460 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Depdc5P61460 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms