Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps5P59438 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps5P59438 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hps5P59438 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps5P59438 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps5P59438 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps5P59438 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hps5P59438 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms