Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf2P58021 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms