Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmoP56726 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmoP56726 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmoP56726 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmoP56726 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmoP56726 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmoP56726 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SmoP56726 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SmoP56726 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SmoP56726 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SmoP56726 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SmoP56726 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SmoP56726 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SmoP56726 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SmoP56726 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SmoP56726 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SmoP56726 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SmoP56726 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SmoP56726 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SmoP56726 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SmoP56726 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SmoP56726 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SmoP56726 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SmoP56726 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SmoP56726 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SmoP56726 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SmoP56726 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SmoP56726 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SmoP56726 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SmoP56726 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SmoP56726 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SmoP56726 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SmoP56726 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SmoP56726 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SmoP56726 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SmoP56726 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SmoP56726 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SmoP56726 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SmoP56726 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SmoP56726 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SmoP56726 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SmoP56726 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SmoP56726 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms