Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cux1P53564 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cux1P53564 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux1P53564 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux1P53564 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux1P53564 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux1P53564 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux1P53564 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cux1P53564 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cux1P53564 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cux1P53564 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cux1P53564 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cux1P53564 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cux1P53564 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms