Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Map3k1P53349 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Map3k1P53349 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms