Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2e3P52483 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms