Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ClgnP52194 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClgnP52194 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ClgnP52194 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ClgnP52194 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ClgnP52194 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ClgnP52194 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms