Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SftpdP50404 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SftpdP50404 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SftpdP50404 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SftpdP50404 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SftpdP50404 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SftpdP50404 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SftpdP50404 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SftpdP50404 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SftpdP50404 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SftpdP50404 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SftpdP50404 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SftpdP50404 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms