Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms