Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb42P49222 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Epb42P49222 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb42P49222 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb42P49222 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epb42P49222 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms