Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rbp3P49194 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.4 ms