Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms