Protein–RNA interactions for Protein: P47911

Rpl6, 60S ribosomal protein L6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl6P47911 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms