Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmx2P43687 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmx2P43687 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms