Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgavP43406 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgavP43406 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgavP43406 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgavP43406 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ItgavP43406 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ItgavP43406 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgavP43406 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgavP43406 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgavP43406 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ItgavP43406 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms