Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nkx2-2P42586 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-2P42586 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms