Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsf9P41274 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf9P41274 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms