Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tjp1P39447 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tjp1P39447 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tjp1P39447 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tjp1P39447 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tjp1P39447 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tjp1P39447 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tjp1P39447 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tjp1P39447 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tjp1P39447 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tjp1P39447 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tjp1P39447 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tjp1P39447 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tjp1P39447 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tjp1P39447 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tjp1P39447 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tjp1P39447 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tjp1P39447 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tjp1P39447 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tjp1P39447 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tjp1P39447 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tjp1P39447 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tjp1P39447 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tjp1P39447 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tjp1P39447 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tjp1P39447 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tjp1P39447 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tjp1P39447 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tjp1P39447 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tjp1P39447 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tjp1P39447 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tjp1P39447 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tjp1P39447 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tjp1P39447 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tjp1P39447 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tjp1P39447 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tjp1P39447 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tjp1P39447 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tjp1P39447 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tjp1P39447 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tjp1P39447 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp1P39447 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp1P39447 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp1P39447 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp1P39447 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp1P39447 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp1P39447 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp1P39447 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tjp1P39447 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp1P39447 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp1P39447 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp1P39447 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp1P39447 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp1P39447 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp1P39447 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tjp1P39447 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tjp1P39447 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tjp1P39447 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tjp1P39447 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tjp1P39447 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tjp1P39447 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tjp1P39447 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tjp1P39447 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tjp1P39447 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tjp1P39447 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms