Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik2P39087 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik2P39087 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik2P39087 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik2P39087 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik2P39087 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grik2P39087 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms