Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpargP37238 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpargP37238 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpargP37238 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpargP37238 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpargP37238 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpargP37238 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PpargP37238 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PpargP37238 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpargP37238 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpargP37238 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpargP37238 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpargP37238 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpargP37238 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpargP37238 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PpargP37238 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpargP37238 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpargP37238 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpargP37238 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpargP37238 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpargP37238 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpargP37238 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpargP37238 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpargP37238 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpargP37238 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpargP37238 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpargP37238 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpargP37238 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpargP37238 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpargP37238 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpargP37238 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpargP37238 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PpargP37238 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpargP37238 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpargP37238 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpargP37238 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpargP37238 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpargP37238 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpargP37238 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpargP37238 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpargP37238 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpargP37238 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpargP37238 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpargP37238 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpargP37238 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpargP37238 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PpargP37238 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpargP37238 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PpargP37238 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpargP37238 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpargP37238 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpargP37238 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpargP37238 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpargP37238 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpargP37238 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpargP37238 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpargP37238 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpargP37238 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PpargP37238 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpargP37238 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpargP37238 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpargP37238 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PpargP37238 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpargP37238 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpargP37238 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpargP37238 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpargP37238 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpargP37238 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpargP37238 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpargP37238 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpargP37238 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpargP37238 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpargP37238 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpargP37238 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpargP37238 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpargP37238 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpargP37238 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpargP37238 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpargP37238 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpargP37238 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PpargP37238 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpargP37238 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpargP37238 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpargP37238 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpargP37238 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpargP37238 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpargP37238 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpargP37238 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpargP37238 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpargP37238 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpargP37238 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpargP37238 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpargP37238 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PpargP37238 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpargP37238 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpargP37238 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpargP37238 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpargP37238 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpargP37238 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PpargP37238 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms