Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rfc1P35601 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms