Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Grin2aP35436 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Grin2aP35436 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms