Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab23P35288 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab23P35288 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab23P35288 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab23P35288 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab23P35288 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rab23P35288 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab23P35288 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab23P35288 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms