Protein–RNA interactions for Protein: P34968

Htr2c, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr2cP34968 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Htr2cP34968 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Htr2cP34968 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms