Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pola2P33611 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pola2P33611 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pola2P33611 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pola2P33611 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pola2P33611 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pola2P33611 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms