Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pola1P33609 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pola1P33609 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Pola1P33609 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pola1P33609 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pola1P33609 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pola1P33609 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pola1P33609 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pola1P33609 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pola1P33609 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pola1P33609 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pola1P33609 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms